Transcriptome
Anatomie du transcrit
Trouver le CDS, mesurer les UTR, traduire la protéine et juger le contexte Kozak
Séquence d’entrée
—Longueur du transcrit
—UTR 5′
—Séquence codante
—UTR 3′
—Longueur de la protéine
—Masse moléculaire
—Point isoélectrique
—Taux de GC
Contexte Kozak autour du codon d’initiation
—
Protéine obtenue
—
Retenir l’ORF la plus longue est une heuristique, pas un fait : le transcrit réel peut démarrer ailleurs. Si vous disposez des coordonnées du CDS depuis une référence, utilisez le mode manuel. Le verdict Kozak ne repose que sur les deux positions les plus déterminantes : une purine en −3 et un G en +4.