Транскриптом
Анатомия транскрипта
Поиск CDS, длины UTR, трансляция белка и оценка контекста Козак
Входная последовательность
—Длина транскрипта
—5′-UTR
—Кодирующая последовательность
—3′-UTR
—Длина белка
—Молекулярная масса
—Изоэлектрическая точка
—Доля GC
Контекст Козак вокруг старт-кодона
—
Получаемый белок
—
Выбор самой длинной ORF — эвристика, а не факт: реальный транскрипт может начинаться в другом месте. Если координаты CDS известны из референса, используйте ручной режим. Оценка контекста Козак опирается лишь на две наиболее значимые позиции: пурин в −3 и G в +4.