توالی
مکمل معکوس و رونویسی
تبدیل توالی DNA به مکمل، معکوس، مکمل معکوس یا RNA، با پشتیبانی از FASTA و بازهای مبهم IUPAC. توالی شما آپلود نمیشود.
توالی ورودی
—
فرمول
5'-ATGGCC-3' → 5'-GGCCAT-3'
- مکمل
- هر باز با جفت خودش عوض میشود: A↔T و G↔C
- معکوس
- ترتیب بازها برعکس میشود، بدون تغییر خود بازها
- مکمل معکوس
- هر دو عمل با هم — همان رشتهٔ مقابل در جهت پنج به سه
مثال حلشده
ساختن پرایمر برگشت از روی انتهای سه پریم ناحیهٔ هدف
- ناحیهٔ هدف: 5'-ATGGCCTAGGAATTCACG-3'
- بیست تا بیستوپنج باز از انتهای سه پریم ناحیه را جدا کنید.
- مکمل معکوس آن را بگیرید.
- نتیجه، پرایمر برگشت است و باید در جهت پنج به سه نوشته شود.
پاسخ 5'-CGTGAATTCCTAGGCCAT-3'
خطاهای رایج
- گرفتن فقط مکمل بهجای مکمل معکوس هنگام طراحی پرایمر برگشت. نتیجه توالی درستی است ولی در جهت اشتباه، و پرایمر کار نمیکند.
- فراموش کردن اینکه همیشه باید توالی را در جهت پنج به سه نوشت. نوشتن رشتهٔ مقابل در جهت سه به پنج منبع رایج سردرگمی در سفارش اولیگوست.
- نادیده گرفتن بازهای مبهم. حرف N و بقیهٔ نمادهای IUPAC هم مکمل دارند؛ این ابزار آنها را درست تبدیل میکند.
پرسشهای متداول
چرا مکمل معکوس با معکوس فرق دارد؟
معکوس فقط ترتیب حروف را برمیگرداند و توالی بیمعنایی میسازد. مکمل معکوس رشتهٔ واقعی مقابل را میدهد، همان که در دورشتهٔ DNA روبهروی توالی شما قرار دارد.
ورودی FASTA پشتیبانی میشود؟
بله. سرخط با علامت بزرگتر خوانده و نگه داشته میشود و در خروجی FASTA دوباره ظاهر میشود.