Séquences
Complément inverse
Transformez une séquence d’ADN en son complément, son inverse, son complément inverse ou en ARN, avec prise en charge du FASTA et des codes d’ambiguïté IUPAC. Votre séquence ne quitte pas le navigateur.
Séquence d’entrée
—
Formule
5'-ATGGCC-3' → 5'-GGCCAT-3'
- complément
- chaque base remplacée par sa partenaire : A↔T et G↔C
- inverse
- l’ordre des bases retourné, les bases elles-mêmes inchangées
- complément inverse
- les deux à la fois — le brin opposé lu de 5′ vers 3′
Exemple résolu
Concevoir une amorce antisens à partir de l’extrémité 3′ d’une région cible
- région cible : 5'-ATGGCCTAGGAATTCACG-3'
- Prenez vingt à vingt-cinq bases à l’extrémité 3′ de la région.
- Calculez le complément inverse de ce segment.
- Le résultat est votre amorce antisens ; elle s’écrit de 5′ vers 3′.
Réponse 5'-CGTGAATTCCTAGGCCAT-3'
Erreurs courantes
- Prendre le complément au lieu du complément inverse pour une amorce antisens. Les bases sont bonnes mais le sens est faux et l’amorce ne fonctionne pas.
- Oublier qu’une séquence s’écrit toujours de 5′ vers 3′. Écrire le brin opposé de 3′ vers 5′ est une source classique de confusion à la commande d’oligos.
- Négliger les codes d’ambiguïté. N et les autres symboles IUPAC ont eux aussi un complément, correctement traité par cet outil.
Questions fréquentes
Quelle différence entre complément inverse et inverse ?
L’inverse ne fait que retourner les lettres et produit une séquence sans signification. Le complément inverse donne le vrai brin opposé, celui qui fait face au vôtre dans l’ADN double brin.
Le FASTA est-il pris en charge ?
Oui. Une ligne d’en-tête commençant par un chevron est lue, conservée, et réapparaît dans le fichier FASTA téléchargé.